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          非編碼RNA也有功能:能調(diào)控免疫系統(tǒng)的“進(jìn)”與“退”

          • 2018年5月8日 FanTianQing來源:新浪新聞 601 34
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          《細(xì)胞》雜志近日刊登中國工程院院士曹雪濤團(tuán)隊的研究論文,他們發(fā)現(xiàn)一種全新非編碼RNA分子。該分子能夠調(diào)控免疫系統(tǒng)的“進(jìn)”與“退”,這是此前學(xué)術(shù)界從未認(rèn)識和證明的。


          海量實驗 頂級期刊的尖銳難題被逐個攻克

          全新的發(fā)現(xiàn),使得團(tuán)隊興奮異常。沒想到的是,更大的磨礪還在后面。

          團(tuán)隊向頂級期刊投稿,審稿人卻要求必須用CLIP(交叉互連免疫沉淀)技術(shù)明確RNA的哪一個點(diǎn)和蛋白質(zhì)相互作用,連接在一起。用語言很難解釋蛋白質(zhì)和RNA在活體細(xì)胞內(nèi)錯綜復(fù)雜的關(guān)聯(lián),姜明紅給記者畫圖:一個長鏈RNA會結(jié)合多個蛋白,這些蛋白有的是特異連接,連得緊密,有的就是“掛”在上面,而蛋白之外還會帶上其他的RNA,“纏繞”“連帶”“虛實”……

          CLIP很難做,國內(nèi)實驗室極少有成熟的經(jīng)驗。收到修改意見后的團(tuán)隊成員開始大量查閱論文?!皣獾膶嶒灹鞒虩o法完全照搬,不同的細(xì)胞做法不同,需要重新摸條件?!眻F(tuán)隊中主要攻關(guān)這一技術(shù)的劉倫說。

          CLIP技術(shù)和RIP(RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀)技術(shù)類似,但是卻能夠達(dá)到單個堿基的分辨率。為此,通過海量實驗,針對裂解液的成分如何影響細(xì)胞內(nèi)物質(zhì),團(tuán)隊開始了如指掌;不同RNA酶的脾氣也熟練掌握。

          “實驗室的部分我們自己攻克了,但是測序公司表示無法進(jìn)行匹配的測序工作,原因是無法合成特有的適當(dāng)引物?!眲愓f,國內(nèi)沒有公司生產(chǎn)CLIP所需引物,而RNA測序必須先反轉(zhuǎn)錄為cDNA才能夠進(jìn)行,引物決定了反轉(zhuǎn)錄的準(zhǔn)確性,決定了目標(biāo)位點(diǎn)能否確定。實驗室自己擔(dān)負(fù)起RNA轉(zhuǎn)錄、構(gòu)建cDNA文庫的工作。完成3代測序、用化學(xué)方法測量分子間的相互作用力……這些免疫研究實驗室原本并不擅長的難題被團(tuán)隊逐個攻克。

          按圖索驥 摸索并掌握一套獨(dú)有技術(shù)體系

          根據(jù)已有發(fā)現(xiàn),團(tuán)隊按圖索驥,利用分子篩層析實驗證實缺失lnc-Lsm3b表達(dá)的巨噬細(xì)胞在感染病毒以后,多聚化的RIG-I蛋白顯著增加。他們推測,病毒RNA與RIG-I結(jié)合以后,能夠誘導(dǎo)RIG-I單體形成多聚化狀態(tài),從而激活下游信號通路。而lnc-Lsm3b只與單體結(jié)合,可能是通過抑制RIG-I的多聚形成抑制RIG-I的活性。

          “Lsm3b只能結(jié)合單體的RIG-I蛋白、一條鏈能結(jié)合9個蛋白、結(jié)合力比病毒RNA高……”這些都是對這個全新RNA分子的多角度了解。

          如同向“黑洞”中打進(jìn)一束光,曹雪濤團(tuán)隊在對現(xiàn)有知識體系顛覆的同時,肯定地回答了學(xué)界之前關(guān)于這類自身RNA分子是否存在、功能幾何的爭議。

          “過去我們用別人的技術(shù)進(jìn)行實驗,現(xiàn)在我們自己摸索并掌握一套獨(dú)有的技術(shù)。”曹雪濤說,整個研究的“練兵”不僅拓展了人類的“知識域”,還拓展了實驗室的思路和眼界。接到《細(xì)胞》雜志編輯部發(fā)來修改要求時感受到的“不可思議”和巨大壓力,團(tuán)隊成員現(xiàn)在已能笑談。

          “只是這段RNA與人類的同源性很低?!苯骷t表示了小小的惋惜,這意味著,該發(fā)現(xiàn)無法直接應(yīng)用于人類的新藥創(chuàng)制領(lǐng)域,但是,其他擁有人源細(xì)胞材料的機(jī)構(gòu),可以沿著這條路,進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)人類機(jī)體內(nèi)是否存在相似的RNA。曹雪濤更看重的是,確定靶點(diǎn)的方法一旦被高質(zhì)量地掌握,就能夠確定蛋白質(zhì)的靶點(diǎn),進(jìn)而確定藥物作用的靶點(diǎn),助力抗病毒藥物的研發(fā)。

          相關(guān):

          RNA

          RNA一般指核糖核酸。核糖核酸(縮寫為RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物細(xì)胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA由核糖核苷酸經(jīng)磷酸二酯鍵縮合而成長鏈狀分子。一個核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和堿基構(gòu)成。RNA的堿基主要有4種,即A腺嘌呤、G鳥嘌呤、C胞嘧啶、U尿嘧啶,其中,U(尿嘧啶)取代了DNA中的T。

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