2017年1月1日，上海機場出入境檢驗檢疫局對1例來自安哥拉疑似感染黃熱病中國籍人員的樣本全基因組進行測序分析，檢出了庫波熱病毒(Ekpoma virus)。該病毒為我國首次檢出，全球第2次發(fā)現(xiàn)。

　　2017年1月1日，質(zhì)檢總局境外傳染病監(jiān)測哨點報告一名來自安哥拉的疑似感染黃熱病人員即將回國治療。上海出入境檢驗檢疫局接質(zhì)檢總局衛(wèi)生司通報后，立即啟動口岸突發(fā)公共衛(wèi)生事件應(yīng)急處置預(yù)案，對入境該名疑似病例及其密切接觸者開展流行病學(xué)調(diào)查、醫(yī)學(xué)排查、采集樣本檢測。

　　上海檢驗檢疫局衛(wèi)生檢疫中心實驗室連夜檢測，與廣東局P3實驗室排除了黃熱病毒、裂谷熱病毒、基孔肯雅病毒、登革病毒、瘧原蟲等多種蟲媒病原體感染和甲乙型流感病毒、肝炎病毒等病原體感染。

　　為進一步查明發(fā)熱原因，上海出入境檢驗檢疫局聯(lián)合中國軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院運用宏基因組測序技術(shù)，檢測分析發(fā)現(xiàn)一片段序列與庫波熱病毒(Ekpoma virus)同源性高達96.5%。其后聯(lián)合江蘇出入境檢驗檢疫局再次開展后續(xù)追蹤調(diào)查，采集樣本進行了全基因測序，于2月21日得到病毒全基因組。該病毒基因組全長為12639bp，經(jīng)序列比對，發(fā)現(xiàn)與尼日利亞的庫波熱病毒2型(EKV2)同源性為96%。進一步做病毒序列進化樹分析，最終確認(rèn)該病毒為庫波熱病毒(Ekpoma virus )。

　　庫波熱病毒(Ekpoma virus)是2015年在西非尼日利亞新發(fā)現(xiàn)的病毒，分1型(EKV1)和2型(EKV2)兩個亞型，主要感染牛，媒介為庫蠓，全球僅有1次報道。同時該病毒與另外一種引起出血熱病死率高的下剛果熱病毒(Bas-congo virus)高度同源，且因病例少，病源生物形狀不明。此次案例的流行病學(xué)調(diào)查表明，患者攜帶病毒時間長達3周以上，而在我國存在該病的傳播媒介——庫蠓，且分布種類多、地區(qū)廣，一旦傳入可能造成流行風(fēng)險。檢驗檢疫部門應(yīng)進一步關(guān)注其生物學(xué)性狀和致病機制的研究。目前上海局已根據(jù)庫波熱病毒(Ekpoma virus)基因序列，建立了相關(guān)快速檢測方法，為該病毒病的防控和診斷試劑的研發(fā)打下基礎(chǔ)。