單細(xì)胞測序技術(shù)是指在單個細(xì)胞水平上,對基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組進(jìn)行高通量測序分析的一項技術(shù)。它能夠揭示單個細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,在腫瘤、發(fā)育生物學(xué)、微生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域發(fā)揮重要作用,正成為生命科學(xué)研究的焦點(diǎn)。單細(xì)胞測序在
細(xì)胞是生物學(xué)的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進(jìn)行單個分離、研究和比較。更大更復(fù)雜的人類細(xì)胞基因組。
什么是單細(xì)胞測序?
單細(xì)胞測序是指DNA研究中涉及測序單細(xì)胞微生物相對簡單的基因組,更大更復(fù)雜的人類細(xì)胞基因組。
以前,需要從大量細(xì)胞中獲取足夠多的DNA進(jìn)行測序,因此測序結(jié)果是這些細(xì)胞"整體"的表征。然而,由于細(xì)胞異質(zhì)性,相同表型的細(xì)胞的遺傳信息可能存在顯著性差異,很多低豐度的信息會在整體表征中丟失。為了彌補(bǔ)傳統(tǒng)高通量測序的局限性,單細(xì)胞測序技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。
單細(xì)胞測序技術(shù)是指在單個細(xì)胞水平上,對基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組進(jìn)行高通量測序分析的一項技術(shù)。它能夠揭示單個細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,在腫瘤、發(fā)育生物學(xué)、微生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域發(fā)揮重要作用,正成為生命科學(xué)研究的焦點(diǎn)。
隨著第二代測序(next generation sequencing,NGS)技術(shù)和第三代測序( third generation sequencing,TGS)技術(shù)的飛速發(fā)展,引起生物研究領(lǐng)域的巨大變革。
有別于傳統(tǒng)的基因芯片,從超過混合數(shù)萬個細(xì)胞中提取的 DNA 或者 RNA 進(jìn)行測序,得出平均值。單細(xì)胞測序可以在單個細(xì)胞層面解析基因組及其表達(dá)調(diào)控特征,能更全面掌握細(xì)胞的功能。 比如在個體的發(fā)育過程中,從受精卵到個體,我們可以通過單細(xì)胞測序來觀察每個細(xì)胞到底發(fā)生了什么樣的變化,再比如臨床治療中,為什么有些藥物對部分人有效,卻對另外一些人沒有效果,這些差別可以通過單細(xì)胞測序得出結(jié)論。
對于多細(xì)胞生物來說,在細(xì)胞的分裂和分化過程中,必然會逐漸產(chǎn)生或大或小的差異,即遺傳信息的異質(zhì)性。例如,同一腫瘤組織中的不同細(xì)胞內(nèi)涵不同基因組和轉(zhuǎn)錄組等遺傳信息,就臨床利用上而言,這種差異或能影響某種療法對該腫瘤起到的作用。
傳統(tǒng)的研究方法是在多細(xì)胞基礎(chǔ)上完成檢測,即一次處理成千上萬個細(xì)胞。比如,當(dāng)研究人員想要檢測某個蛋白的表達(dá)量,常用的方法如Western Blot等,最終得到的信號值反映的其實是基因在群體細(xì)胞中的表達(dá)平均后水平,這就會導(dǎo)致不同細(xì)胞間表達(dá)異質(zhì)性信息的丟失。但如果運(yùn)用單細(xì)胞測序方法,如流式細(xì)胞術(shù)技術(shù),在單細(xì)胞水平對熒光強(qiáng)度加以測定,就能完全反應(yīng)同一個細(xì)胞群里不同細(xì)胞的基因組和轉(zhuǎn)錄組等遺傳信息的狀況。
單細(xì)胞測序行業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀調(diào)研
細(xì)胞是生物體內(nèi)發(fā)揮功能的基本結(jié)構(gòu)單元。單細(xì)胞測序技術(shù)是近年來生命科學(xué)領(lǐng)域的突破性技術(shù),能夠檢測單個細(xì)胞內(nèi)的多種遺傳物質(zhì)與功能分子,有助于更加深入地理解細(xì)胞功能,探索生命發(fā)育和疾病發(fā)生等機(jī)制。然而,不同組學(xué)組合、不同測序技術(shù)、不同測序樣本的“馬賽克”式單細(xì)胞數(shù)據(jù)的整合是巨大的挑戰(zhàn)。
為此,應(yīng)曉敏團(tuán)隊自主研發(fā)了基于生成式人工智能的新算法,在國際上首次實現(xiàn)了通用的單細(xì)胞多組學(xué)馬賽克數(shù)據(jù)的模態(tài)對齊、數(shù)據(jù)補(bǔ)全、批次校正等整合功能,為構(gòu)建大規(guī)模多組學(xué)細(xì)胞圖譜、實現(xiàn)大規(guī)模單細(xì)胞多組學(xué)分析與知識遷移提供了關(guān)鍵性的原創(chuàng)技術(shù),性能達(dá)到國際領(lǐng)先水平。
近日,軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院應(yīng)曉敏團(tuán)隊在國際著名學(xué)術(shù)期刊《自然·生物技術(shù)》以Article類長文形式在線發(fā)表重大原創(chuàng)研究成果。該團(tuán)隊自主研發(fā)的用于單細(xì)胞多組學(xué)數(shù)據(jù)馬賽克整合的人工智能算法取得新突破。
據(jù)中研產(chǎn)業(yè)研究院《2023-2028年全球及中國單細(xì)胞測序行業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀調(diào)研及投資前景分析報告》分析:
單細(xì)胞測序主要有四個工作流程:單細(xì)胞制備、單細(xì)胞分離和文庫制備、測序和初級分析、生信分析。單細(xì)胞制備通常采用機(jī)械法、酶解法或其他組合方案將組織裂解,隨后將特定的細(xì)胞群富集、標(biāo)記,成為單細(xì)胞樣本。單細(xì)胞分離與文庫制備是單細(xì)胞測序的關(guān)鍵步驟,與最終單細(xì)胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量、精準(zhǔn)度息息相關(guān)。
從商業(yè)模式來看,國內(nèi)的單細(xì)胞測序廠商主要分為兩類,一類是以自有設(shè)備耗材研發(fā)為主線的產(chǎn)品提供商,國內(nèi)外廠商如10X、BD、墨卓、德運(yùn)康瑞、達(dá)普、M20等;一類是以提供單細(xì)胞測序服務(wù)為主要業(yè)務(wù)形態(tài)的科研服務(wù)商(目前單細(xì)胞測序以服務(wù)科研用戶為主),國內(nèi)廠商如諾禾致源、安諾優(yōu)達(dá)、博奧晶典、百奧智匯、烈冰生物等。還有一類是像新格元、尋因生物這種起先以10X平臺對外提供科研服務(wù)的廠商,后來逐漸推出自己的單細(xì)胞測序平臺,既可以對外提供單細(xì)胞測序服務(wù),又可以對外提供設(shè)備耗材。
單細(xì)胞測序在國內(nèi)外主要的目標(biāo)人群包括科研機(jī)構(gòu)、高校、醫(yī)院、診斷機(jī)構(gòu)、以及生物技術(shù)公司和藥企等。目前主要以科研市場為主,臨床應(yīng)用端還未有成熟的產(chǎn)品落地。
本報告根據(jù)單細(xì)胞測序行業(yè)的發(fā)展軌跡及多年的實踐經(jīng)驗,對中國單細(xì)胞測序行業(yè)的內(nèi)外部環(huán)境、行業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀、產(chǎn)業(yè)鏈發(fā)展?fàn)顩r、市場供需、競爭格局、標(biāo)桿企業(yè)、發(fā)展趨勢、機(jī)會風(fēng)險、發(fā)展策略與投資建議等進(jìn)行了分析,并重點(diǎn)分析了我國單細(xì)胞測序行業(yè)將面臨的機(jī)遇與挑戰(zhàn),對單細(xì)胞測序行業(yè)未來的發(fā)展趨勢及前景作出審慎分析與預(yù)測。
想要了解更多單細(xì)胞測序行業(yè)詳情分析,可以點(diǎn)擊查看中研普華研究報告《2023-2028年全球及中國單細(xì)胞測序行業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀調(diào)研及投資前景分析報告》。
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2023-2028年全球及中國單細(xì)胞測序行業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀調(diào)研及投資前景分析報告
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