單細(xì)胞測(cè)序相關(guān)研究與日俱增。該技術(shù)已廣泛應(yīng)用于科研行業(yè)神經(jīng)生物學(xué)、種系傳播、器官生長(zhǎng)、癌癥生物學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域的研究。
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)是指在單個(gè)細(xì)胞水平上,對(duì)基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組進(jìn)行高通量測(cè)序分析的一項(xiàng)技術(shù)。它能夠揭示單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,在腫瘤、發(fā)育生物學(xué)、微生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域發(fā)揮重要作用,正成為生命科學(xué)研究的焦點(diǎn)。
以前,需要從大量細(xì)胞中獲取足夠多的DNA進(jìn)行測(cè)序,因此測(cè)序結(jié)果是這些細(xì)胞"整體"的表征。然而,由于細(xì)胞異質(zhì)性,相同表型的細(xì)胞的遺傳信息可能存在顯著性差異,很多低豐度的信息會(huì)在整體表征中丟失。為了彌補(bǔ)傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。
單細(xì)胞測(cè)序相關(guān)研究與日俱增。該技術(shù)已廣泛應(yīng)用于科研行業(yè)神經(jīng)生物學(xué)、種系傳播、器官生長(zhǎng)、癌癥生物學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域的研究。
2022單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)應(yīng)用現(xiàn)狀與投資前景
近日,騰訊研究成果登《Nature》子刊:「scBERT」模型攻克單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析痛點(diǎn)。
騰訊在論文中創(chuàng)新性地提出關(guān)于單細(xì)胞注釋的“scBERT”算法模型,受到《Nature Machine Intelligence》雜志評(píng)審高度認(rèn)可,表示該成果對(duì)于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域未來(lái)研究具有深遠(yuǎn)意義。
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)是生命科學(xué)領(lǐng)域的一項(xiàng)革命性技術(shù),可以細(xì)粒度地觀察和刻畫各個(gè)物種中組織、器官和有機(jī)體中單細(xì)胞分子圖譜(細(xì)胞表達(dá)),便于更好地了解腫瘤微環(huán)境,以達(dá)到精細(xì)分析病因、精準(zhǔn)匹配治療方案的效果,對(duì)于“精準(zhǔn)醫(yī)療”具有極高的應(yīng)用價(jià)值。
值得注意的是,受數(shù)據(jù)樣本量小、人工干預(yù)多、過(guò)度依賴marker gene(已報(bào)道的特異性基因)等因素的影響,單細(xì)胞測(cè)序細(xì)胞類型注釋技術(shù)一直面臨著泛化性、可解釋性、穩(wěn)定性均比較低的問(wèn)題,現(xiàn)存的算法難以有更廣泛的應(yīng)用。
針對(duì)以上問(wèn)題,論文中首次提出“基于大規(guī)模預(yù)訓(xùn)練語(yǔ)言模型的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞類型注釋算法”,即“scBERT”模型,首次將“transformer”(自然語(yǔ)言處理算法經(jīng)典計(jì)算單元)運(yùn)用到單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域。
根據(jù)中研普華研究院《2022-2027年全球及中國(guó)單細(xì)胞測(cè)序行業(yè)發(fā)展調(diào)研及投資前景分析報(bào)告》顯示:
2019年9月,美國(guó)單細(xì)胞測(cè)序公司10x Genomics在納斯達(dá)克上市,IPO3.9億美元,成為該領(lǐng)域的領(lǐng)頭羊。國(guó)內(nèi)單細(xì)胞測(cè)序行業(yè)發(fā)展較為滯后,但也頗受資本青睞。2019年3月,萬(wàn)乘基因完成五百萬(wàn)元天使輪融資;6月,百奧智匯完成A輪融資,新格元生物完成近億元pre-A輪融資;10月,尋因生物完成數(shù)千萬(wàn)元pre-A輪融資。
單細(xì)胞測(cè)序即從單個(gè)細(xì)胞水平上對(duì)基因組進(jìn)行測(cè)序,把基因測(cè)序應(yīng)用到單個(gè)細(xì)胞層面,從而識(shí)別細(xì)胞的類型、功能,特定細(xì)胞健康或狀態(tài)的變化、變異。而常規(guī)的基于NGS的基因檢測(cè),都是在大量細(xì)胞宏觀水平上,對(duì)整個(gè)細(xì)胞群進(jìn)行遺傳分析。
在基因?qū)用妫瑔渭?xì)胞測(cè)序可以獲取更精準(zhǔn)的遺傳信息,在蛋白層面,通過(guò)分析單細(xì)胞表達(dá)的蛋白可以直接的獲取人體免疫相關(guān)的靶點(diǎn),用于免疫診斷、新藥研發(fā)等。鑒于蛋白質(zhì)不具有直接擴(kuò)增的特性,以及蛋白質(zhì)組學(xué)分析靈敏度的限制,單細(xì)胞蛋白分析的常見(jiàn)、有效技術(shù)是質(zhì)譜分析,主要技術(shù)包括質(zhì)譜流式細(xì)胞術(shù)(Mass Cytometry)、TOF-SIMS(飛行時(shí)間二次離子質(zhì)譜儀)分析等。
質(zhì)譜流式技術(shù)平臺(tái)最初由美國(guó)DVS Science開(kāi)發(fā),但這家企業(yè)于2014年被美國(guó)Fluidigm以2.1億美元收購(gòu)。國(guó)內(nèi)單細(xì)胞蛋白分析的代表企業(yè)為宸安生物、普羅亭,其中,宸安生物專注單細(xì)胞質(zhì)譜流式診斷設(shè)備、試劑和軟件開(kāi)發(fā),普羅亭致力于以單細(xì)胞蛋白層面研究為核心的檢測(cè)服務(wù)。
無(wú)論是基因?qū)用?,還是蛋白層面,單細(xì)胞分析技術(shù)已然成熟,但囿于成本并未廣泛應(yīng)用于市場(chǎng)上,更多的是為科研提供服務(wù)。動(dòng)脈網(wǎng)整理了全球單細(xì)胞行業(yè)的目前發(fā)展?fàn)顩r,以及單細(xì)胞技術(shù)在贏來(lái)大規(guī)模應(yīng)用之前面臨的挑戰(zhàn)與機(jī)遇。
隨著單細(xì)胞測(cè)序行業(yè)競(jìng)爭(zhēng)的不斷加劇,大型企業(yè)間并購(gòu)整合與資本運(yùn)作日趨頻繁,國(guó)內(nèi)外優(yōu)秀的單細(xì)胞測(cè)序企業(yè)愈來(lái)愈重視對(duì)行業(yè)市場(chǎng)的分析研究,特別是對(duì)當(dāng)前市場(chǎng)環(huán)境和客戶需求趨勢(shì)變化的深入研究,以期提前占領(lǐng)市場(chǎng),取得先發(fā)優(yōu)勢(shì)。
《2022-2027年全球及中國(guó)單細(xì)胞測(cè)序行業(yè)發(fā)展調(diào)研及投資前景分析報(bào)告》由中研普華研究院撰寫,本報(bào)告對(duì)該行業(yè)的供需狀況、發(fā)展現(xiàn)狀、行業(yè)發(fā)展變化等進(jìn)行了分析,重點(diǎn)分析了行業(yè)的發(fā)展現(xiàn)狀、如何面對(duì)行業(yè)的發(fā)展挑戰(zhàn)、行業(yè)的發(fā)展建議、行業(yè)競(jìng)爭(zhēng)力,以及行業(yè)的投資分析和趨勢(shì)預(yù)測(cè)等等。報(bào)告還綜合了行業(yè)的整體發(fā)展動(dòng)態(tài),對(duì)行業(yè)在產(chǎn)品方面提供了參考建議和具體解決辦法。
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2022-2027年全球及中國(guó)單細(xì)胞測(cè)序行業(yè)發(fā)展調(diào)研及投資前景分析報(bào)告
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